Les élèves pharmaciens sont recrutés par concours commun avec les élèves médecins. Ils sont inscrits auprès de l'université de Lyon où ils suivent le même enseignement que les étudiants civils.

Ils se présentent dans les mêmes conditions que les étudiants civils au concours sanctionnant la fin du premier cycle des études pharmaceutiques (PCEP1). Un échec à ce concours est susceptible d'entraîner l'exclusion de l'élève en cas de résultats insuffisants.

Les études pharmaceutiques s'effectuent sur deux cycles. Le 1er cycle dure 2 ans et le 2ème cycle 4 ans, sanctionné par la soutenance d'une thèse.